La influencia humana y la homogeneización biótica impulsan la distribución de genes de virulencia de Escherichia coli en hábitats naturales

El ganado es el principal reservorio de la toxina Shiga productora de Escherichia coli  (STEC), el único patotipo de E. coli intestinal zoonótico conocido. Sin embargo, hay otros patotipos intestinales que pueden causar enfermedades en humanos, cuya presencia rara vez se ha investigado. Por lo tanto, nuestro objetivo fue identificar los efectos de la presión antrópica y de la abundancia de ungulados silvestres y domésticos en la distribución y diversidad de los principales patotipos de E. coli humanos y nueve de sus genes de virulencia representativos (VG). 

Utilizamos una PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) para la detección y cuantificación directa del gen específico del género uid A, nueve VG de E. coli ( stx1 , sxt 2, eaeehx A, agg R, est , elt , bfp A, inv A), así como cuatro genes relacionados con los serotipos O157 : H7 ( rfb O157 , fli C H7 ) y O104: H4 ( wzx O104 , fli C H4 ) en animales (heces de ciervos, vacas y jabalíes) y muestras de agua recolectadas en tres áreas del Parque Nacional de Doñana (DNP), España. Ocho de los nueve VG se detectaron, siendo inv A, eae y stx 2 seguidos de stx 1, agg R y ehxA los más abundantes. 

En términos cuantitativos (copias de genes por mg de muestra), stx 1 y stx 2 dieron los valores más altos. Se observaron diferencias significativas con respecto a los VG en las tres especies animales en las tres áreas muestreadas. Los genes relacionados con el serotipo se encontraron en todos los tipos de muestra menos uno. En general, los VG fueron más diversos y abundantes en la parte norte del parque, donde las aguas superficiales están más contaminadas por desechos humanos y granjas. 

En el estudio demostramos que la influencia humana es más relevante que las especies hospedadoras en la configuración de E. coli VGs patrón espacial y diversidad en DNP. Además, la vida silvestre podría ser reservorio potencial para otros patotipos diferentes de STEC, sin embargo, se necesitarían más pasos de aislamiento para caracterizar completamente a esas E. coli.

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